一代药王欧阳岚，侥幸救下奄奄一息的岳灵珊，将她收为入室女弟子。之后，岳灵珊与药王谷大弟子张小龙等在药王谷习武、学医的三年，张小龙与岳灵珊情投意合，相互暧昧，大有结成夫妻之势。但是，没过多久，倭国天峰家族十三太保前来挑战中原武林，逼迫药王谷交出药方和医术良方，杀害沿海百姓。岳灵珊前往东南寻得华山派大师兄令狐冲和任盈盈相助，一举打退了来犯的天峰家族，保全了药王谷和中原武林。但倭国天皇得了不治之症，非拿到药王谷药方和医术秘籍不可，于是逼迫天峰家族再次来犯。他们诱降张小龙，杀了任盈盈，夺得张小龙的鸳鸯剑，意图威逼岳灵珊交出鸳鸯剑后得到秘方，令狐冲也因丧妻之痛自尽而亡。

后来，历经磨难的岳灵珊与药王谷二师兄王亮一起合练鸳鸯剑法，武功大成，协助戚继光大将军成功打败来犯的倭寇，与王亮隐居逍遥